.GENBANK - นามสกุลไฟล์

ไฟล์ genbank คืออะไร?

ไฟล์ genbank เป็นไฟล์ข้อความที่มีข้อมูลลำดับทางชีวภาพเช่น DNA หรือลำดับโปรตีน มันเป็นหนึ่งในรูปแบบไฟล์ที่พบบ่อยที่สุดที่ใช้ในการจัดเก็บข้อมูลลำดับทางชีวภาพ ไฟล์ genbank ถูกสร้างและบำรุงรักษาโดยศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ (NCBI)

ไฟล์ genbank แบ่งออกเป็นสามส่วนหลัก:

• ส่วนหัว: ส่วนหัวมีข้อมูลเกี่ยวกับลำดับเช่นสิ่งมีชีวิตที่มาจากความยาวของลำดับและวันที่ถูกส่ง
• คุณสมบัติ: ส่วนคุณสมบัติมีข้อมูลเกี่ยวกับคุณสมบัติของลำดับเช่นยีน exons และ introns
• ลำดับ: ส่วนลำดับมี DNA จริงหรือลำดับโปรตีน

ไฟล์ GenBank เป็นทรัพยากรที่มีค่าสำหรับนักชีววิทยาและนักวิจัยด้านชีวสารสนเทศ พวกเขาเป็นวิธีที่ได้มาตรฐานในการจัดเก็บและแบ่งปันข้อมูลลำดับทางชีวภาพ ข้อมูลนี้สามารถใช้ในการศึกษาโครงสร้างฟังก์ชันและวิวัฒนาการของยีนและโปรตีน นอกจากนี้ยังสามารถใช้ในการพัฒนายาใหม่และการรักษาโรค

นี่คือ ประโยชน์บางอย่างของการใช้ไฟล์ genbank:

• พวกเขาเป็นรูปแบบมาตรฐานที่ใช้กันอย่างแพร่หลายโดยนักชีววิทยาและนักวิจัยชีวสารสนเทศศาสตร์
• พวกเขาสามารถเก็บข้อมูลลำดับทางชีวภาพที่หลากหลายรวมถึง DNA, RNA และลำดับโปรตีน
• พวกเขาสามารถแชร์ได้อย่างง่ายดายและแลกเปลี่ยนระหว่างโปรแกรมซอฟต์แวร์ที่แตกต่างกัน
• พวกเขาสามารถแปลงเป็นรูปแบบไฟล์อื่น ๆ เช่น FASTA และ XML

หากคุณกำลังทำงานกับ ข้อมูลลำดับทางชีวภาพ คุณควรคุ้นเคยกับ ไฟล์ genbank พวกเขาเป็นทรัพยากรที่มีค่าที่สามารถช่วยคุณจัดเก็บแบ่งปันและวิเคราะห์ข้อมูลของคุณ

จะเปิดแก้ไขและแปลงไฟล์ genbank ได้อย่างไร?

มีหลายวิธีในการเปิดแก้ไขและแปลง ไฟล์ genbank นี่คือวิธีการบางอย่าง:

เพื่อเปิดไฟล์ genbank:

• คุณสามารถใช้ตัวแก้ไขข้อความเช่น Notepad หรือ Sublime Text
• คุณสามารถใช้ผู้ชม genbank พิเศษเช่น Seqman หรือ Geneious
• คุณสามารถใช้ตัวชม genbank บนเว็บได้เช่นผู้ชม NCBI genbank

ในการแก้ไขไฟล์ genbank:

• คุณสามารถใช้ตัวแก้ไขข้อความได้ แต่อาจเป็นเรื่องยากและผิดพลาดได้ง่าย
• เป็นการดีกว่าที่จะใช้ตัวแก้ไข genbank พิเศษเช่น Seqman หรือ Geneious

ในการแปลงไฟล์ genbank เป็นรูปแบบอื่น:

• คุณสามารถใช้ตัวแก้ไขข้อความเพื่อแปลงไฟล์ด้วยตนเอง
• นอกจากนี้ยังมีโปรแกรมซอฟต์แวร์จำนวนมากที่สามารถแปลงไฟล์ genbank เป็นรูปแบบอื่น ๆ เช่น FASTA และ XML

นี่คือโปรแกรมซอฟต์แวร์เฉพาะบางส่วนที่คุณสามารถใช้เพื่อเปิดแก้ไขและแปลงไฟล์ genbank:

• Seqman : Seqman เป็นโปรแกรมซอฟต์แวร์เชิงพาณิชย์ที่มีให้สำหรับ Windows, Mac และ Linux มันเป็นผู้ชม genbank ที่ทรงพลังและตัวแก้ไขที่สามารถใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูลลำดับทางชีวภาพ
• Geneious: Geneious เป็นโปรแกรมซอฟต์แวร์เชิงพาณิชย์อื่นที่มีให้สำหรับ Windows, Mac และ Linux มันเป็นชุดชีวสารสนเทศศาสตร์ที่ครอบคลุมซึ่งรวมถึงตัวชม genbank และตัวแก้ไข
• BioEdit: BioEdit เป็นโปรแกรมซอฟต์แวร์ฟรีและโอเพ่นซอร์สที่พร้อมใช้งานสำหรับ Windows, Mac และ Linux มันเป็นมุมมอง genbank พื้นฐานและตัวแก้ไขที่สามารถใช้ในการแก้ไขข้อมูลลำดับทางชีวภาพประเภทอื่น ๆ
• NCBI genbank Viewer: NCBI genbank Viewer เป็นผู้ชม genbank บนเว็บที่สามารถเข้าถึงได้จากคอมพิวเตอร์เครื่องใดก็ได้ที่มีการเชื่อมต่ออินเทอร์เน็ต เป็นเครื่องมือที่ใช้งานง่ายและใช้งานง่ายที่สามารถใช้ในการดูและค้นหาไฟล์ genbank

ข้อมูลใดถูกเก็บไว้ในไฟล์ genbank

ไฟล์ genbank มีข้อมูลที่หลากหลายเกี่ยวกับลำดับทางชีวภาพรวมถึง:

• สิ่งมีชีวิตลำดับมาจาก
• ความยาวของลำดับ
• วันที่ส่งลำดับ
• หมายเลขภาคยานุวัติที่กำหนดให้กับลำดับ
• ลำดับของตัวเอง
• คุณสมบัติของลำดับเช่นยีน exons และ introns
• การอ้างอิงข้ามไปยังฐานข้อมูลอื่น ๆ
• การอ้างอิงวรรณกรรม

ข้อมูลใน ไฟล์ GenBank ถูกจัดเป็นสามส่วนหลัก:

• ส่วนหัว: ส่วนหัวมีข้อมูลทั่วไปเกี่ยวกับลำดับเช่นสิ่งมีชีวิตหมายเลขภาคยานุวัติและวันที่ส่งมา
• คุณสมบัติ: ส่วนคุณสมบัติมีข้อมูลเกี่ยวกับคุณสมบัติของลำดับเช่นยีน exons และ introns
• ลำดับ: ส่วนลำดับมี DNA จริงหรือลำดับโปรตีน

ส่วนส่วนหัวและคุณสมบัติของไฟล์ genbank ถูกจัดรูปแบบโดยใช้ไวยากรณ์เฉพาะ ไวยากรณ์นี้ช่วยให้โปรแกรมซอฟต์แวร์สามารถแยกวิเคราะห์ข้อมูลในไฟล์ได้อย่างง่ายดาย

ส่วนลำดับของไฟล์ genbank เป็นเพียงลำดับ DNA หรือโปรตีนในบรรทัดเดียว ลำดับมักจะแสดงด้วยตัวอักษร A, C, G และ T สำหรับลำดับ DNA และตัวอักษร A, C, G และ U สำหรับลำดับ RNA

ไฟล์ GenBank เป็นทรัพยากรที่มีค่าสำหรับนักชีววิทยาและนักวิจัยด้านชีวสารสนเทศ พวกเขาเป็นวิธีที่ได้มาตรฐานในการจัดเก็บและแบ่งปันข้อมูลลำดับทางชีวภาพ ข้อมูลนี้สามารถใช้ในการศึกษาโครงสร้างฟังก์ชันและวิวัฒนาการของยีนและโปรตีน นอกจากนี้ยังสามารถใช้ในการพัฒนายาใหม่และการรักษาโรค

วิธีค้นหาไฟล์ genbank?

มีหลายวิธีในการค้นหา ไฟล์ GenBank นี่คือวิธีการบางอย่าง:

• ใช้เครื่องมือค้นหา NCBI Entrez: เครื่องมือค้นหา NCBI Entrez เป็นเครื่องมือที่ทรงพลังที่สามารถใช้ในการค้นหาไฟล์ genbank และข้อมูลชีวภาพประเภทอื่น ๆ คุณสามารถค้นหาด้วยคำหลักหมายเลขภาคยานุวัติหรือเกณฑ์อื่น ๆ
• ใช้เครื่องมือค้นหา genbank พิเศษ: มีเครื่องมือค้นหา genbank พิเศษจำนวนมากเช่นเครื่องมือ NCBI Blast และ NCBI genbank Viewer เครื่องมือเหล่านี้สามารถใช้ในการค้นหาไฟล์ genbank ที่ตรงกับเกณฑ์เฉพาะเช่นยีนหรือลำดับโปรตีนเฉพาะ
• ใช้เครื่องมือค้นหา genbank บนเว็บบนเว็บ: มีเครื่องมือค้นหา genbank บนเว็บจำนวนมากเช่นการค้นหา NCBI genbank และตัวชม genbank เครื่องมือเหล่านี้สามารถใช้ในการค้นหาไฟล์ genbank จากคอมพิวเตอร์ใด ๆ ที่มีการเชื่อมต่ออินเทอร์เน็ต

นี่คือคำค้นหาเฉพาะที่คุณสามารถใช้เพื่อค้นหา ไฟล์ GenBank :

• หมายเลขภาคยานุวัติ: หมายเลขภาคยานุวัติเป็นตัวระบุเฉพาะที่กำหนดให้กับไฟล์ genbank แต่ละไฟล์ คุณสามารถค้นหาไฟล์ genbank ได้โดยหมายเลขภาคยานุวัติโดยป้อนหมายเลขภาคยานุวัติในช่องค้นหา
• ชื่อยีน: คุณสามารถค้นหาไฟล์ genbank โดยชื่อยีนโดยป้อนชื่อยีนในช่องค้นหา
• ชื่อโปรตีน: คุณสามารถค้นหาไฟล์ genbank โดยชื่อโปรตีนโดยป้อนชื่อโปรตีนในช่องค้นหา
• สปีชีส์: คุณสามารถค้นหาไฟล์ genbank โดยสปีชีส์โดยป้อนชื่อสปีชีส์ในกล่องค้นหา
• ฟังก์ชั่น: คุณสามารถค้นหาไฟล์ genbank โดยฟังก์ชั่นโดยป้อนฟังก์ชั่นของยีนหรือโปรตีนในช่องค้นหา