.CRAM - 파일 확장자

EBI가 개발 한 압축 정렬 파일 형식, 유럽 분자 생물학 실험실의 전환; BWA, BBMAP 및 BLAT와 같은 짧은 읽기 정렬에서 생성 된 짧은 DNA 서열 읽기 정렬을 저장합니다.

CRAM 파일 형식은 BAM (Binary Alignment/Map) 파일 형식과 유사하지만 파일 압축이 우수하고 재구성 된 열 지향 바이너 컨테이너 형식을 특징으로합니다. 유전자 소프트웨어 분야의 데이터 볼륨이 증가함에 따라 CRAM 형식은 정렬 데이터의 디스크 발자국을 줄이기 위해 설계되었습니다.

짧은 읽기 정렬은 게놈에서 서열이 나오는 해독 과정입니다. 기준 게놈이 다소 크고 참조 게놈에서 정확한 일치를 항상 찾고 있지 않기 때문에 이것은 어려울 수 있습니다. 짧은 읽기 정렬기는 일치 및 거의 일치에 대한 거대한 시퀀스를 검색하는 데 사용됩니다. 시퀀스는 너무 크기 때문에 파일 크기를 관리하기 위해서는 CRAM와 같은 형식으로 제공되는 압축이 필요합니다.