.CRAM - Расширение файла

Формат файла сжатого выравнивания, разработанный EBI, выходом из европейской лаборатории молекулярной биологии; хранят короткие выравнивания последовательности ДНК, генерируемые из коротких выравнивателей чтения, таких как BWA, BBMAP и BLAT.

Формат файла CRAM аналогичен формату файла бинарного выравнивания/карты (BAM), но функционирует лучшее сжатие файла и реструктурированный формат двоичного контейнера, ориентированный на столбца. По мере увеличения объемов данных в генетическом программном поле формат CRAM был разработан для уменьшения печати дисковой ноги данных выравнивания.

Короткое выравнивание чтения - это процесс расшифровки, откуда поступает последовательность в геноме. Это может быть сложно, так как эталонный геном довольно большой, и вы не всегда ищете точные совпадения в эталонном геноме. Короткие выравнивания чтения используются для поиска огромных последовательностей для совпадений и почти матчей. Поскольку последовательности настолько велики, сжатие, обеспечиваемое такими форматами, как CRAM, необходимо для поддержания управляемых размеров файлов.