.CRAM - Extensión de archivo

Formato de archivo de alineación comprimido desarrollado por EBI, una estación externa del Laboratorio Europeo de Biología Molecular; Contabilidad de secuencia de ADN corta Alineaciones de lectura generadas a partir de alineadores de lectura corta como BWA, BBMAP y Blat.

El formato de archivo CRAM es similar al formato de archivo de alineación binaria/MAP (BAM), pero presenta una mejor compresión del archivo y un formato de contenedor binario orientado a columna reestructurado. A medida que aumentan los volúmenes de datos en el campo de software genético, el formato CRAM fue diseñado para reducir la impresión del pie de disco de los datos de alineación.

La alineación de lectura corta es el proceso de descifrar de dónde proviene una secuencia en el genoma. Esto puede ser difícil ya que el genoma de referencia es bastante grande y no siempre está buscando coincidencias exactas en el genoma de referencia. Los alineadores de lectura corta se utilizan para buscar enormes secuencias para coincidencias y casi partidos. Dado que las secuencias son tan grandes, la compresión proporcionada por formatos como CRAM es necesaria para mantener manejables los tamaños de los archivos.