.CRAM - Ekstensi Berkas

Format file penyelarasan terkompresi yang dikembangkan oleh EBI, sebuah outstation dari Laboratorium Biologi Molekuler Eropa; Menyimpan urutan DNA pendek baca keberpihakan yang dihasilkan dari pelurus baca pendek seperti BWA, BBMAP, dan Blat.

Format file CRAM mirip dengan format file Alignment/MAP (BAM) biner tetapi fitur kompresi file yang lebih baik dan format wadah biner yang berorientasi kolom yang direstrukturisasi. Seiring meningkatnya volume data dalam bidang perangkat lunak genetik, format CRAM dirancang untuk mengurangi cetakan kaki disk dari data penyelarasan.

Penyelarasan bacaan pendek adalah proses menguraikan dari mana suatu urutan berasal dalam genom. Ini bisa sulit karena genom referensi agak besar dan Anda tidak selalu mencari kecocokan yang tepat dalam genom referensi. Penyel, pembacaan pendek digunakan untuk mencari urutan yang sangat besar untuk kecocokan dan hampir-cocok. Karena urutannya sangat besar, kompresi yang disediakan oleh format seperti CRAM diperlukan untuk menjaga ukuran file dapat dikelola.