Co to jest. Plik CLC ?
A . Plik CLC jest formatem pliku binarnego używanego przez CLC Bio Software , pakiet narzędzi bioinformatycznych do analizy sekwencji DNA i RNA. Pliki Bio CLC mogą zawierać różne rodzaje danych, w tym:
- Sekwencje DNA i RNA
- Wyrównania
- Adnotacje
- Drzewa filogenetyczne
- Obrazy
- Pliki projektu
Pliki Bio CLC są zwykle używane do przechowywania i udostępniania danych między różnymi modułami oprogramowania Bio CLC . Na przykład możesz użyć pliku biologicznego CLC do przechowywania wyników wyrównania sekwencji DNA, a następnie zaimportować ten plik do innego modułu bio CLC do przeprowadzenia analizy filogenetycznej.
Pliki Bio CLC można również wyeksportować do innych formatów plików, takich jak FASTA, FASTQ i Newick . Pozwala to udostępniać swoje dane innym badaczom, którzy mogą korzystać z różnych pakietów oprogramowania.
Oto kilka przykładów, w jaki sposób używane są pliki bio CLC :
- Badacz może użyć pliku biologicznego CLC do przechowywania wyników wyrównania sekwencji DNA różnych genomów bakteryjnych.
- Kliniczny genetyk może użyć pliku biologicznego CLC do przechowywania wyników analizy wariantu genetycznego.
- Biolog roślin może użyć pliku biologicznego CLC do przechowywania wyników analizy filogenetycznej różnych gatunków roślin.
Jak otworzyć. Plik CLC
Otworzyć. Plik CLC , będziesz musiał zainstalować oprogramowanie CLC Bio na komputerze. CLC Bio to pakiet narzędzi bioinformatycznych do analizy sekwencji DNA i RNA. Możesz pobrać bezpłatną próbę biografii CLC ze strony internetowej Qiagen (wspomnianej powyżej).
Po zainstalowaniu Bio CLC możesz otworzyć. Plik CLC , klikając go dwukrotnie. Plik zostanie otwarty w głównym stole warsztatowym CLC Bio.
Jak przekonwertować. Plik CLC do innego formatu pliku? (Konwertuj CLC na snapgene)
Do konwersji. Plik CLC do innego formatu pliku można użyć narzędzia CLC Bio Export . Aby to zrobić, wykonaj następujące kroki:
- Otworzyć . Plik CLC w bio CLC .
- Przejdź do menu pliku i wybierz Eksport.
- Wybierz format pliku, na który chcesz przekonwertować plik.
- Kliknij przycisk Eksportuj.
CLC Bio może eksportować pliki do różnych formatów, w tym FASTA , FASTQ , Newick i Snapgene .
Importowanie i eksport danych w formatach Bio CLC
Aby zaimportować dane do biografii CLC , możesz użyć narzędzia do importu Bio CLC . Aby to zrobić, wykonaj następujące kroki:
- Przejdź do menu pliku i wybierz Importuj.
- Wybierz typ pliku, który chcesz zaimportować.
- Kliknij przycisk Przeglądaj i wybierz plik, który chcesz zaimportować.
- Kliknij przycisk Importuj.
CLC Bio może importować dane z różnych formatów, w tym FASTA, FASTQ, Newick i Snapgene.
Aby wyeksportować dane z CLC Bio, możesz użyć narzędzia CLC Bio Export. Aby to zrobić, postępuj zgodnie z powyższymi krokami.
Zaimportuj plik CLC do Geneous
Aby zaimportować plik CLC do Geneous , wykonaj następujące kroki:
- Otwórz Geneous Prime .
- Przejdź do menu pliku i wybierz Importuj.
- Wybierz format pliku Bio CLC z listy obsługiwanych formatów.
- Kliknij przycisk Przeglądaj i wybierz plik CLC , który chcesz zaimportować.
- Kliknij przycisk Importuj.
Geneous zaimportuje plik CLC i utworzy nowy dokument zawierający dane.
Rozwiązywanie problemów typowych błędów plików bio -plików CLC
Jeśli masz problemy z otwieraniem lub korzystaniem z pliku bio CLC , możesz wypróbować kilka rzeczy:
- Upewnij się, że masz zainstalowaną najnowszą wersję CLC Bio.
- Spróbuj otworzyć plik na innym komputerze.
- Spróbuj przekształcić plik na inny format, taki jak FASTA lub FUSTQ.
- Skontaktuj się z obsługą Qiagen w celu uzyskania pomocy.
Jak używać BIO CLC do analizy danych sekwencjonowania nowej generacji
Aby użyć BIO CLC do analizy danych sekwencjonowania nowej generacji, wykonaj następujące kroki:
- Zaimportuj dane sekwencjonowania do biografii CLC .
- Wykonaj kontrolę jakości danych.
- Wyrównaj dane do genomu referencyjnego.
- Zidentyfikuj i adnotuj warianty genetyczne.
- Wykonaj analizę dalszej, taką jak analiza różnicowa lub analiza filogenetyczna.
CLC Bio zapewnia różnorodne narzędzia dla każdego etapu rurociągu analizy danych sekwencjonowania nowej generacji. Aby uzyskać bardziej szczegółowe instrukcje, zapoznaj się z dokumentacją Bio CLC .