何ですか。 CLCファイル?
a。 CLCファイルは、DNAおよびRNA配列を分析するためのバイオインフォマティクスツールのスイートであるCLC Bio Softwareが使用するバイナリファイル形式です。 CLCバイオファイルには、以下を含むさまざまな種類のデータを含めることができます。
- DNAおよびRNA配列
- アライメント
- 注釈
- 系統樹
- 画像
- プロジェクトファイル
CLCバイオファイルは、通常、異なるCLCバイオソフトウェアモジュール間でデータを保存および共有するために使用されます。たとえば、 CLCバイオファイルを使用してDNAシーケンスアラインメントの結果を保存し、そのファイルを別のCLCバイオモジュールにインポートして系統発生分析を実行できます。
CLC Bioファイルは、Fasta、FastQ 、 Newickなどの他のファイル形式にエクスポートすることもできます。これにより、さまざまなソフトウェアパッケージを使用している可能性のある他の研究者とデータを共有できます。
CLCバイオファイルがどのように使用されるかの例をいくつか紹介します。
- 研究者は、 CLCバイオファイルを使用して、異なる細菌ゲノムのDNA配列アラインメントの結果を保存する場合があります。
- 臨床遺伝学者は、 CLCバイオファイルを使用して、遺伝的変異分析の結果を保存する場合があります。
- 植物の生物学者は、 CLCバイオファイルを使用して、異なる植物種の系統解析の結果を保存する場合があります。
開く方法。 CLCファイル
Aを開くには。 CLCファイルでは、コンピューターにCLC Bioソフトウェアをインストールする必要があります。 CLC Bioは、DNAおよびRNA配列を分析するためのバイオインフォマティクスツールのスイートです。 Qiagen Webサイト(上記)からCLC Bioの無料トライアルをダウンロードできます。
CLCバイオをインストールしたら、Aを開くことができます。 CLCファイルをダブルクリックして。ファイルはCLC Bio Main Workbenchで開きます。
変換する方法a。別のファイル形式へのCLCファイル? ( CLCをSnapgeneに変換)
aを変換する。 CLCファイルは別のファイル形式に、 CLC Bio Exportツールを使用できます。これを行うには、次の手順に従ってください。
- 開きます。 CLCバイオのCLCファイル。
- [ファイル]メニューに移動し、[エクスポート]を選択します。
- ファイルを変換するファイル形式を選択します。
- [エクスポート]ボタンをクリックします。
CLC Bioは、 Fasta 、 FastQ 、 Newick 、 Snapgeneなど、さまざまな形式にファイルをエクスポートできます。
CLCバイオ形式でデータのインポートとエクスポート
データをCLC Bioにインポートするには、 CLC Bio Import Toolを使用できます。これを行うには、次の手順に従ってください。
- [ファイル]メニューに移動し、[インポート]を選択します。
- インポートするファイルタイプを選択します。
- [参照]ボタンをクリックして、インポートするファイルを選択します。
- [インポート]ボタンをクリックします。
CLC Bioは、Fasta、FastQ、Newick、Snapgeneなど、さまざまな形式からデータをインポートできます。
CLC Bioのデータをエクスポートするには、 CLC Bio Exportツールを使用できます。これを行うには、上記の手順に従ってください。
CLCファイルをGeneiousにインポートします
CLCファイルをGeneiousにインポートするには、次の手順に従ってください。
- Geneious Primeを開きます。
- [ファイル]メニューに移動し、[インポート]を選択します。
- サポートされている形式のリストからCLCバイオファイル形式を選択します。
- [参照]ボタンをクリックし、インポートするCLCファイルを選択します。
- [インポート]ボタンをクリックします。
GeneiousはCLCファイルをインポートし、データを含む新しいドキュメントを作成します。
一般的なCLCバイオファイルエラーのトラブルシューティング
CLCバイオファイルの開設や使用に問題がある場合は、試してみることができることがいくつかあります。
- CLC Bioの最新バージョンがインストールされていることを確認してください。
- 別のコンピューターでファイルを開いてみてください。
- FASTAやFastQなど、ファイルを別の形式に変換してみてください。
- Qiagenサポートにお問い合わせください。
CLCバイオを使用して次世代シーケンスデータを分析する方法
CLCバイオを使用して次世代シーケンスデータを分析するには、次の手順に従ってください。
- シーケンスデータをCLCバイオにインポートします。
- データの品質制御を実行します。
- データを参照ゲノムに合わせます。
- 遺伝的変異を特定して注釈を付けます。
- 微分発現分析や系統解析などの下流分析を実行します。
CLC Bioは、次世代シーケンスデータ分析パイプラインの各ステップにさまざまなツールを提供します。より詳細な手順については、 CLCバイオドキュメントを参照してください。